Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smg6P61406 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smg6P61406 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms