Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3eP60229 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3eP60229 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms