Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2aP59997 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2aP59997 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2aP59997 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms