Protein–RNA interactions for Protein: P59900

Emilin3, EMILIN-3, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin3P59900 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Emilin3P59900 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emilin3P59900 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms