Protein–RNA interactions for Protein: P59279

Rab2b, Ras-related protein Rab-2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2bP59279 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2bP59279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab2bP59279 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms