Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp4P59240 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp4P59240 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms