Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcif1P59114 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms