Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace1P56818 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace1P56818 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bace1P56818 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bace1P56818 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms