Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RabggtbP53612 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RabggtbP53612 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RabggtbP53612 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms