Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl9P51670 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl9P51670 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms