Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma2P49722 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma2P49722 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma2P49722 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma2P49722 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psma2P49722 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma2P49722 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma2P49722 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma2P49722 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms