Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf1P46099 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klf1P46099 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klf1P46099 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf1P46099 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf1P46099 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms