Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chd1P40201 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd1P40201 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chd1P40201 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chd1P40201 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Chd1P40201 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd1P40201 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Chd1P40201 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Chd1P40201 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd1P40201 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chd1P40201 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Chd1P40201 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms