Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnga1P29974 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnga1P29974 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms