Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp1P29452 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp1P29452 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp1P29452 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp1P29452 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp1P29452 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casp1P29452 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp1P29452 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp1P29452 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms