Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprmP28828 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprmP28828 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprmP28828 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprmP28828 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprmP28828 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprmP28828 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprmP28828 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprmP28828 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprmP28828 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprmP28828 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PtprmP28828 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
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