Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc6a9P28571 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms