Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa2P28309 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Defa2P28309 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa2P28309 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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