Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb9P28076 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb9P28076 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb9P28076 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms