Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RdxP26043 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RdxP26043 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RdxP26043 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RdxP26043 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RdxP26043 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RdxP26043 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RdxP26043 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RdxP26043 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RdxP26043 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RdxP26043 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RdxP26043 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RdxP26043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RdxP26043 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RdxP26043 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RdxP26043 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RdxP26043 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RdxP26043 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RdxP26043 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RdxP26043 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RdxP26043 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RdxP26043 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RdxP26043 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RdxP26043 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RdxP26043 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RdxP26043 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RdxP26043 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RdxP26043 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RdxP26043 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RdxP26043 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RdxP26043 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms