Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccnd1P25322 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms