Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1P24860 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1P24860 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1P24860 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1P24860 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnb1P24860 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccnb1P24860 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnb1P24860 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnb1P24860 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms