Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdcP23738 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdcP23738 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HdcP23738 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdcP23738 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdcP23738 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HdcP23738 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HdcP23738 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HdcP23738 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HdcP23738 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HdcP23738 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HdcP23738 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HdcP23738 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HdcP23738 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HdcP23738 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HdcP23738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms