Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prim1P20664 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prim1P20664 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prim1P20664 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim1P20664 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prim1P20664 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prim1P20664 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prim1P20664 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms