Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fcer1aP20489 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms