Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RargP18911 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RargP18911 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RargP18911 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RargP18911 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RargP18911 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RargP18911 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RargP18911 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RargP18911 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RargP18911 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RargP18911 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RargP18911 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RargP18911 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RargP18911 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RargP18911 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RargP18911 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RargP18911 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RargP18911 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RargP18911 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RargP18911 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RargP18911 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RargP18911 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RargP18911 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RargP18911 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RargP18911 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RargP18911 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RargP18911 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RargP18911 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RargP18911 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RargP18911 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RargP18911 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RargP18911 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RargP18911 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RargP18911 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RargP18911 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RargP18911 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RargP18911 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RargP18911 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RargP18911 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RargP18911 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms