Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phka1P18826 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phka1P18826 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phka1P18826 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phka1P18826 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phka1P18826 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms