Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpraP18052 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtpraP18052 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms