Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmga1P17095 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmga1P17095 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmga1P17095 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms