Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptan1P16546 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms