Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RhoP15409 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhoP15409 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RhoP15409 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RhoP15409 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RhoP15409 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RhoP15409 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RhoP15409 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RhoP15409 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RhoP15409 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhoP15409 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RhoP15409 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhoP15409 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RhoP15409 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhoP15409 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhoP15409 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhoP15409 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhoP15409 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhoP15409 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhoP15409 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhoP15409 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhoP15409 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhoP15409 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhoP15409 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhoP15409 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhoP15409 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhoP15409 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RhoP15409 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhoP15409 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms