Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AppP12023 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AppP12023 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AppP12023 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AppP12023 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AppP12023 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AppP12023 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AppP12023 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AppP12023 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AppP12023 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AppP12023 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AppP12023 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AppP12023 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AppP12023 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AppP12023 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AppP12023 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AppP12023 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AppP12023 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AppP12023 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AppP12023 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AppP12023 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AppP12023 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AppP12023 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AppP12023 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AppP12023 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AppP12023 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AppP12023 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AppP12023 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AppP12023 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AppP12023 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AppP12023 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AppP12023 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AppP12023 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AppP12023 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AppP12023 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AppP12023 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AppP12023 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AppP12023 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AppP12023 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AppP12023 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AppP12023 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AppP12023 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AppP12023 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AppP12023 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AppP12023 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AppP12023 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AppP12023 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AppP12023 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms