Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fgf4P11403 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgf4P11403 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms