Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnp2P11378 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tnp2P11378 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms