Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FlgP11088 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FlgP11088 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FlgP11088 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FlgP11088 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FlgP11088 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FlgP11088 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FlgP11088 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FlgP11088 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FlgP11088 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FlgP11088 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FlgP11088 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FlgP11088 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FlgP11088 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FlgP11088 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FlgP11088 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FlgP11088 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FlgP11088 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FlgP11088 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FlgP11088 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FlgP11088 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FlgP11088 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FlgP11088 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FlgP11088 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FlgP11088 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FlgP11088 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FlgP11088 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FlgP11088 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FlgP11088 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FlgP11088 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FlgP11088 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FlgP11088 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FlgP11088 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FlgP11088 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FlgP11088 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FlgP11088 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FlgP11088 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FlgP11088 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FlgP11088 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms