Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prf1P10820 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prf1P10820 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prf1P10820 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms