Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Amd1P0DMN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Amd1P0DMN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Amd1P0DMN7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms