Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AfpP02772 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AfpP02772 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AfpP02772 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AfpP02772 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AfpP02772 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AfpP02772 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AfpP02772 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AfpP02772 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AfpP02772 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AfpP02772 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AfpP02772 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AfpP02772 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AfpP02772 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AfpP02772 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AfpP02772 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AfpP02772 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AfpP02772 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AfpP02772 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AfpP02772 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AfpP02772 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AfpP02772 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AfpP02772 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AfpP02772 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AfpP02772 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AfpP02772 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms