Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01793 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01793 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01793 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01793 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01793 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01793 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01793 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01793 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01793 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01793 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01793 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms