Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01746 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01746 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01746 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P01746 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01746 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01746 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01746 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01746 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01746 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01746 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01746 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01746 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01746 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01746 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01746 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01746 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01746 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01746 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms