Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01678 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01678 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01678 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01678 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01678 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01678 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01678 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01678 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01678 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01678 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01678 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01678 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01678 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P01678 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01678 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01678 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01678 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms