Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01647 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01647 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01647 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01647 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01647 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01647 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01647 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01647 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P01647 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01647 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P01647 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01647 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01647 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01647 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01647 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01647 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01647 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01647 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01647 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01647 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01647 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01647 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01647 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01647 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01647 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01647 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01647 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01647 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01647 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01647 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01647 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01647 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01647 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01647 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01647 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01647 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01647 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms