Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ier5O89113 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ier5O89113 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ier5O89113 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ier5O89113 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ier5O89113 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms