Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx8O88983 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx8O88983 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms