Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BlmO88700 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
BlmO88700 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
BlmO88700 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BlmO88700 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BlmO88700 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BlmO88700 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BlmO88700 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BlmO88700 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BlmO88700 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BlmO88700 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BlmO88700 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
BlmO88700 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BlmO88700 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
BlmO88700 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BlmO88700 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BlmO88700 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BlmO88700 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
BlmO88700 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BlmO88700 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BlmO88700 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BlmO88700 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BlmO88700 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BlmO88700 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BlmO88700 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BlmO88700 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BlmO88700 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BlmO88700 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BlmO88700 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BlmO88700 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BlmO88700 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BlmO88700 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BlmO88700 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BlmO88700 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
BlmO88700 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
BlmO88700 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
BlmO88700 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BlmO88700 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BlmO88700 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BlmO88700 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BlmO88700 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BlmO88700 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BlmO88700 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BlmO88700 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BlmO88700 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BlmO88700 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BlmO88700 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms