Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp2O88554 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp2O88554 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp2O88554 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp2O88554 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Parp2O88554 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp2O88554 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms