Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn2O88552 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn2O88552 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn2O88552 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn2O88552 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn2O88552 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms