Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vamp4O70480 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp4O70480 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vamp4O70480 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vamp4O70480 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms