Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lnx1O70263 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lnx1O70263 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lnx1O70263 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms