Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StrnO55106 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
StrnO55106 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
StrnO55106 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
StrnO55106 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
StrnO55106 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
StrnO55106 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
StrnO55106 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
StrnO55106 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
StrnO55106 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
StrnO55106 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
StrnO55106 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
StrnO55106 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
StrnO55106 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
StrnO55106 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
StrnO55106 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
StrnO55106 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
StrnO55106 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms